Identification of diagnostic, prognostic and new major and minor susceptibility genes to pheochromacytoma amd paragangliomas (PCC/PGL)
Author
Currás Freixes, MaríaAdvisor
Robledo Batanero, MercedesEntity
UAM. Departamento de Bioquímica; Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)Date
2017-05-18Subjects
Cáncer - Genética - Tesis doctorales; Biología y Biomedicina / BiologíaNote
Tesis doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Medicina, Departamento de Bioquímica. Fecha de lectura: 18-05-2017Esta tesis tiene embargado el acceso al texto completo hasta el 18-11-2018
Esta obra está bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional.
Abstract
ANTECEDENTES: El diagnóstico genético se recomienda en todos los pacientes con feocromocitoma (FEO) y paraganglioma (PGL), (FPGL), ya que el 65-80% se explican por una mutación en uno de los 34 genes descritos. Se han propuesto distintos algoritmos de diagnóstico genético, pero suelen excluir los FPGL esporádicos (FPGL-E) y ninguno incluye el estudio de mutaciones somáticas (MS). Además, como la lista de genes relacionados con FPGL no para de crecer cada año, el diagnóstico genético implica cada vez más tiempo, y los paneles de genes mediante secuenciación masiva (PG-NGS) emergen como una herramienta rentable y efectiva.
OBJETIVOS: Nuestro objetivo fue aclarar la heterogeneidad genética en el desarrollo de los FPGL mediante el estudio genético sistemático. El estudio se realizó en dos partes sucesivas.
MATERIAL Y MÉTODOS: La parte I incluyó 329 propósitus y se centró en la caracterización genética de pacientes con FPGL-E mediante la secuenciación por Sanger (SS) y las grandes deleciones de los principales genes relacionados con FPGL. Noventa y nueve tumores de los pacientes sin mutación germinal (MG) se incluyeron en el estudio de MS en RET, VHL, HRAS, EPAS1, MAX y SDHB. En la parte II el estudio genético se realizó de forma “ciega” utilizando 2 PG-NGS. Uno permitía el estudio en ADN germinal y de tumor congelado y el segundo fue específicamente diseñado para DNA extraído de tumor parafinado. En el segundo estudio se incluyeron 453 pacientes con FPGL (30 de ellos controles con mutaciones patogénicas conocidas y 275 habían sido parcialmente estudiados mediante SS (WTPS)).
RESULTADOS: Parte I: se encontraron MGs en 46 pacientes (14%), siendo más frecuentes en PGLs (28.7%) que en FEOs (4,5%) (p=6.62×10-10). Los PGLs de cabeza y cuello (CC-PGLs) y los torácicos (T-PGLs), más comúnmente presentaban MGs (p=2.0×10-4 y p=0.027, respectivamente), pero no los abdominales (A-PGLs). Se encontraron MSs en el 43% de los tumores estudiados, y fueron más frecuentes en FEOs (48,5%) que en PGLs (32.3%) (p=0.13). Cinco casos metastásicos y un cuarto de los FPGL-E presentaban una MS, independientemente de la edad. Parte II: el abordaje con NGS mostró una sensibilidad ≥99.4%, independientemente del tipo de ADN. Se identificaron 45 variantes de significado desconocido y 89 mutaciones, siendo MGs 29 (7,2%) y MSs 58 (31,7%) en los 183 tumores estudiados (37 se encontraron en los casos WTPS).
CONCLUSIONES: Recomendamos priorizar el estudio de MG en los pacientes con un único CC-PGL y T PGL, y de MS en FEO. El fenotipo catecolaminérgico y la IHC-SDHB deberían guiar el estudio genético, principalmente en A-PGLs únicos. Los casos pediátricos y metastásicos no deberían excluirse del estudio somático. Ambos PG-NGS son una alternativa eficiente y precisa a la SS, que facilita el estudio de genes “minoritarios” de FPGL y el diagnóstico genético en pacientes con datos clínicos incongruentes o ausentes, que de otra manera no serían diagnosticados.
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