Desarrollo de una plataforma informática para la búsqueda de nuevos fármacos

Abstract

El estudio del espacio farmacológico es una tarea muy compleja y la utilización de la gran cantidad de información que contiene con el fin de desarrollar nuevos fármacos obliga a aplicar un gran número de técnicas y aproximaciones En este trabajo se han aplicado dos rutas diferentes para construir una plataforma computacional que permita el descubrimiento de nuevos fármacos. Por un lado se han desarrollado herramientas para el análisis y la simulación de las interacciones intermoleculares entre los fármacos y sus dianas presentes en los complejos tridimensionales, lo que nos permite predecir la afinidades de unión y proponer nuevas moléculas candidatas. Por otro lado, se ha introducido un cambio radical en el concepto tradicional de diseño asistido por ordenador al incluir la farmacología de sistemas y el análisis de múltiples variables del espacio químico-biológico para poder estimar perfiles polifarmacológicos, efectos adversos y los complejos caminos de optimización que llevan desde un posible candidato a un nuevo fármaco.

The study of pharmacological space is indeed a complex task because its tortuous nature demands a large number of techniques and approximations to exploit the information that it contains with the aim of developing new drugs. For dealing with the complexities involved in the construction of a fully functional computational platform for drug discovery In this work we have developed several tools for: (1) simulation and analysis of intermolecular interactions present in three-dimensional complexes comprising compounds and targets; and (2) approaching systems pharmacology and multivariate analysis of chemico-biological space with a view to predicting polypharmacology binding profiles, side effects and complex optimization routes from promising candidates to full drugs.