Análisis de secuencias de proteínas orientado a la localización de dominios
Advisor
Andrade Navarro, Miguel AngelDate
2005-12-21Subjects
Proteínas - Análisis - Tesis doctorales; Biología y Biomedicina / BiologíaNote
Tesis doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 21-12-2005Abstract
El trabajo desarrollado en esta tesis trata sobre la disciplina del análisis
de secuencias proteicas, con la intención de mostrar relaciones de homología
entre ellas y la consiguiente definición de dominios o regiones conservadas en
alineamientos múltiples de proteínas. Permitiendo de esta forma el
establecimiento de hipótesis de similitud funcional entre aquellas proteínas
similares en secuencia. Aplicando, al análisis de secuencias, el Segundo
Postulado del Método de Descartes: "Dividir cada una de las dificultades a
examinar, en este caso secuencias de proteínas, en tantas partes (dominios) como
sea posible y necesario para resolverlas mejorn [Descartes, 16371.
Aplicamos un abordaje metodológico común a los análisis de diferentes
secuencias de proteínas con el objeto de identificar dominios a nivel de secuencia,
evaluando su conservación y distribución entre diferentes familias de proteínas.
Con el propósito principal de racionalizar e interpretar la similitud de secuencia
en términos funcionales comunes, tales como: interacciones con otras moléculas o
proteínas, mecanismos de reacción y10 regulación coincidentes, etc.
Identificamos varios dominios en proteínas vinculadas a diversas
enfermedades humanas, ofreciendo de éste modo nuevos puntos de vista para su posterior caracterización experimental. The work developed in this PhD dissertation focuses in general on protein
sequence analysis. The aim of this work is first to show homologous relationships
within proteins and secondly to define either novel domains or well conserved
regions in multiple sequence alignmenta. This strategy allows to set up the
hypothesis of functional relatedness between proteins which are similar at the
seqüenct: kvd. Tle criiei-ia appiieci in iloe rneihdoiogy foiiows the second iaw oi
Descartes: "To divide each of the dficulties under examination, proteins in this
case, into as many parta (domains) as possible and as might be necessary for its
adequate solution" [Descartes, 16371.
We apply a common methodological approach to different protein
sequences in order to identiSr domains at sequence level, evaluating their
consewation and distribution among different protein families. With the
principal intention of rationalising and interpreting common functions for
pmteins of similar sequence, such as: interactions with other molecules or
proteins, coincidental mechanisms of reaction and andlor regulation, etc.
We identify several protein domains linked to diverse human diseases, in
this way offering new ideas for later experimental validation.
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PDF
Description
"Texto de la Tesis Doctoral"
Google Scholar:Sánchez Pulido, Luís Francisco
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