Mitochondrial control of gene expression and extrinsic apoptosis
Author
Díaz Colunga, Juan
Entity
UAM. Departamento de Física de la Materia Condensada; CSIC. Centro Nacional de Biotecnología (CNB)Date
2019-04-23Subjects
Biofísica - Tesis doctorales; Citología - Tesis doctorales; Biomatemáticas - Tesis doctorales; FísicaNote
Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Física de la Materia Condensada. Fecha de lectura: 23-04-2019
Esta obra está bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional.
Abstract
Even under homogeneous environmental conditions, cells with identical genotypes can
display significant variations at the phenotypic level, that is, di erences in size, morphology
and internal state. This is a result of the genetic and signaling circuits that
control cellular functions being subject to fluctuations in the levels of their components.
Cell-to-cell variability is regarded as an essential agent in many key cellular activities
such as development, di erentiation, evolution, virus infection or cell death, and has
been shown to serve a biological function in many cases. Thus, tracing back its sources
is central to understand the behaviors of individual cells and ultimately act on them. In
this work we use a combination of experimental, mathematical and computational tools
to investigate the role of mitochondria (the main energy provider in eukaryotic cells) on
the generation of gene expression noise. Gene expression is highly energy demanding
and in turn determines phenotype, pointed as the cause of variable individual cellular
responses in several processes, notably apoptosis. Heterogeneity in apoptotic outcomes
is particularly relevant as it poses the main cause of tumor resistance to chemotherapy.
Our results highlight the importance of mitochondria as a global modulator of gene expression,
but also reveal its role regulating complex, non-linear processes like alternative
splicing. We found that this control of gene expression is specially important in the apoptotic
signaling pathway: mitochondria exhibit the power to discriminate apoptotic fates
at the single cell level, making it a good candidate for a biomarker of the susceptibility
of cancer cells to death-inducing treatments.
i Incluso en condiciones ambientales homog´eneas, c´elulas con genotipos id´enticos
pueden presentar variaciones significativas a nivel fenot´ıpico, es decir, diferencias en
tama˜no, morfolog´ıa y estado interno. Esto es el resultado de los circutos gen´eticos y
de se˜nalizaci´on que controlan la funci´on celular estando sometidos a fluctuaciones en
los niveles de sus componentes. La variabilidad de c´elula a c´elula es considerada un
agente esencial en multitud de actividades celulares como el desarrollo, diferenciaci´on,
evoluci´on, infecci´on v´ırica o la muerte celular. Por tanto, identificar sus fuentes es central
para entender los comportamientos de c´elulas individuales y en ´ultima instancia
actuar sobre ellos. En este trabajo utilizamos una combinaci´on de herramientas experimentales,
matem´aticas y computacionales para investigar el papel de la mitocondria
(principal proveedor de energ´ıa en c´elulas eucariotas) en la generaci´on de ruido en
expresi´on gen´etica. La expresi´on gen´etica es costosa energ´eticamente y determina el
fenotipo, se˜nalado en muchos procesos como causa de la variabilidad en las respuestas
de c´elulas individuales, en particular en el de apoptosis. La heterogeneidad en los resultados
apopt´oticos es particularmente relevante porque supone la principal causa de
resistencia de tumores a quimioterapia. Nuestros resultados resaltan la importancia de
la mitocondria como modulador global de la expresi´on g´enica, pero tambi´en revelan su
papel regulando procesos complejos y no lineales como el splicing alternativo. Encontramos
que este control de la expresi´on g´enica es especialmente importante en la ruta
de se˜nalizaci´on apopt´otica: la mitocondria muestra el potencial de discriminar destinos
apopt´oticos a nivel de c´elula ´unica, convirti´endola en un buen candidato a biomarcador
de la susceptibilidad de c´elulas cancer´ıgenas frente a tratamientos inductores de apoptosis.
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