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PikaVirus 2.0, una herramienta de análisis metagenómico, para su uso en el diagnóstico e identificación de virus

Author
Gorines Cordero, Guillermo Jorge
Advisor
Cuesta de la Plaza, Isabel (Tutora); Monzón Fernández, Sara (Tutora); López Bueno, Albertountranslated
Entity
UAM. Departamento de Ingeniería Informática
Date
2021
Subjects
Informática
URI
http://hdl.handle.net/10486/700289

Licencia de Creative Commons
Esta obra está bajo una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional.

Abstract

En este trabajo se presenta PikaVirus, un software en Nextflow, diseñado para la identificación del genoma viral en muestras metagenómicas, siguiendo una aproximación de alineamiento o mappingde lecturas frente a genomas de referencia. El software se evalúa mediante datos generados in-silico, y muestras clínicas, además de compararse frente a otros programas que también se desarrollaron para la identificación de genomas virales.
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