Sistema de información de Gliomas y análisis de expresión diferencial de líneas celulares de Glioblastoma Multiforme

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dc.contributor.advisor Ayuso Sacido, Ángel (tutor)
dc.contributor.advisor Carrillo de Santa Pau, Enrique (tutor)
dc.contributor.author Moreno Boiza, Vanesa
dc.contributor.other UAM. Departamento de Bioquímica es_ES
dc.date.accessioned 2018-05-23T14:35:03Z
dc.date.available 2018-05-23T14:35:03Z
dc.date.issued 2018-01
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10486/682499
dc.description Trabajo fin de máster en Bioinformática y Biología Computacional es_ES
dc.description.abstract The Glioblastoma Multiforme (GBM) is the most aggressive brain tumor in the adult, with an average survival of 15 months. It is currently a research object by the HM hospitals research foundation (FiHM), in order to discover biomarkers aiming at becoming therapeutical targets for patient treatment and which in turn can cut down experimental test cost. The Foundation counts on a large volume of data regarding tumor line experiments, otherwise untreatable on a manual basis. Bioinformatics tools have been employed in order to design an information system and a data model with facilitates usage, storage and data retrieval. On the other hand, a differential expression analysis has been carried out among U373, U87 and LN229 glioblastoma tumor lines, by means of Nextpresso pipeline. Different expression outcome discloses mismatches among GBM tumor lines, amounting 4357 differentially expressed genes (DE) between lines U373 and U87, 6007 genes between lines LN229 and U373 as well as 4860 between lines LN229 and U87. Distinct active routes related to angiogenesis have been located too, chiefly in those lines with a lesser proliferation of blood vessels, concurring with the output of previous FiHM experimental trials such as ELISA and inmunofluorescence. Accordingly, we suggest the implementation of further surveys regarding relevant genes for their likely utilization as biomarkers en_US
dc.description.abstract El Glioblastoma Multiforme (GBM) se trata del tumor cerebral más agresivo en el adulto, con una supervivencia media de 15 meses. Es objeto de estudio por la fundación de investigación HM hospitales (FiHM) para encontrar biomarcadores que sirvan de dianas terapéuticas para el tratamiento de pacientes y puedan reducir los costes de ensayos experimentales. La fundación dispone de gran cantidad de datos de experimentos de líneas tumorales difícilmente tratables de manera manual. Se han empleado herramientas bioinformáticas para diseñar un sistema de información y un modelo de datos que facilita el acceso, almacenamiento y recuperación de los datos. Además, se ha realizado un análisis de expresión diferencial entre las líneas tumorales de Glioblastoma U373, U87 y LN229, mediante el pipeline de Nextpresso. Los resultados de expresión diferencial revelan diferencias entre las líneas tumorales de GBM con un total de 4357 genes diferencialmente expresados (DE) entre las líneas U373 y U87, 6007 genes entre las líneas LN229 y U373 y 4860 entre las líneas LN229 y U87. También se han encontrado diferentes rutas activas relacionadas con la angiogénesis en mayor medida en las líneas con menor proliferación de vasos sanguíneos, coincidiendo con resultados de previos experimentos de la FiHM como ELISA e inmunofluorescencia. Por lo que sugerimos nuevos estudios sobre genes relevantes de este estudio para un posible uso como biomarcadores es_ES
dc.format.extent 73 pag. en
dc.format.mimetype application/pdf en
dc.language.iso spa en
dc.subject.other Glioblastoma multiforme es_ES
dc.subject.other Gliomas es_ES
dc.title Sistema de información de Gliomas y análisis de expresión diferencial de líneas celulares de Glioblastoma Multiforme es_ES
dc.type masterThesis en
dc.subject.eciencia Biología y Biomedicina / Biología es_ES
dc.subject.eciencia Informática es_ES
dc.rights.cc Reconocimiento – NoComercial – SinObraDerivada es_ES
dc.rights.accessRights openAccess en


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